Waktu permberian kompos yang tepat sangat mempengaruhi kualitas hasil pertanian
Waktu yang tepat:

1. Saat setelah panen
   • Pada saat ini, cadangan makanan untuk mikroorganisme berlimpah sehingga ini merupakan waktu yang tepat untuk pemberian kompos dan mikroorganisme dapat berkembang biak optimal pada tanah
2. Saat sebelum tanam
   • Pada saat ini, kompos yang mengandung mikroorganisme dapat bertahan karena hubungan mutual antara tanaman dan mikroorganisme. Adanya jaminan bahwa mikroorganisme dapat menyediakan eksudat bagi mikroorganisme.
3. Saat tanaman sudah ada (pemupukan kompos rutin)
   • Alasannya sama dengan yang diatas, saat ada tanaman maka mikroorganisme bisa mendapatkan makanan dari eksudat.

Waktu yang tidak tepat:

1. Saat tengah musim kemarau panjang
   • Pada saat ini, kondisi tanah tidak mendukung kehidupan mikroorganisme, kondisi tanah yang kering menyebabkan aktivitas mikroorganisme terhambat dan mengubahnya menjadi fasa dorman.
2. Saat tanah gundul dan tidak ada tumbuhan
   • Pemupukan kompos pada saat seperti ini akan menyebabkan mikroorganisme kesulitan mencari makanannya, karena tidak ada / tidak cukup banyak tanaman yang dapat menyediakan eksudat.